Integration Site Alignment
tRNA 2¡: ******* ++++---Dloop---++++ |||||- Aloop (intron) -||||| vvvvv-Vloop-vvvvv ooooo-Tloop-ooooo******* &
Bme15G GCGGGTATGATGTAA TGGT AGCCTGTCAGCTTCCCA AGCTGA ACGC GCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGC TCCA
Mlo38S GGAGGGATGGCCGAG CGGTTTAAGGCACCGGTCTTGAA AACCGGC GTGGGC GCAA GTTCACCGTGGGTTCGAATCCCACTCCCTCC GCCA
RP3 R GCCTCCGTAGCTCAG GGGA TAGAGCACCGCTCTCCTA AAGCGG GTGTC GCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGC ACCA
Gamma R GCGCCCGTAGCTCAA CGGA TAGAGCATCTGACTACGG ATCAGA AGGTT GGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGC ACaa+2
Nos40G GCGGGCGTAGTTTAG TGGT AAAACTATAGCCTTCCA AGCTAT TAAT GCGGGTTCGATTCCCGCCGCCCGC TCtt
Sco21R GCCCCCGTAGCTCAG GGGA TAGAGCAACGGCCTCCGG AGCCGT GTGC GCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGC ACCc
Stic134F GCCCGGATAGCTCAG TCGGT AGAGCAGGGGATTGAAA ATCCCC GTGTC CTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGC ACCA+1
Ape38V GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGT TAGGACGCCGCCCTTACA CGGCGG AGGTC CGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCC ACCA
pSLP1 Y GGCGGTGTGCCCGAG CGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAA ATCTGCC GGC TCA GCC TTCCCAGGTTCGAATCCTGGCGCCGCC ACac+36
Bsu21L GCGGTCGTGGCGGAA TGGC AGACGCGCTAGGTTGAGG GCCTAG TGGGT GAATA ACCCG TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGC Atca
Scr94 F GCCCGGATAGCTCAG TCGGT AGAGCAGGGGATTGAAA ATCCCC GTGTC CTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGC ACCA+2
pSG1 S GGAGGGTTGCCCGAG CGGCCTAAGGGAACGGTCTTGAA AACCGTC GTGGTG GCGA CATCACCGTGGGTTCGAATCCCACACCCTCC GCag
933M S GGAAGTGTGGCCGAG CGGTTGAAGGCACCGGTCTTGAA AACCGGC GACCC GAAA GGGTT CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCC GCCA
CP4-6 T GCCGATATAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCGCATTCGTA ATGCGA AGGTC GTAGGTTCGACTCCTATTATCGGC ACCA+11
phi16-3 P CGGAGTGTAGCGCAGTCTGGT AGCGCACCACGTTCGGG ACGTGG GGGTC GAGTGTTCGAATCACTCCACTCCG ACCA+2
Mlo45V GGGCGATTAGCTCAG TTGGT AGAGCGCTTCGTTTACA CCGAAG ATGTC GGCGGTTCGAGCCCGTCATCGCCC ACCA
D3 L GCGGACGTGGTGGAA TTGGT AGACACACTGGATTTAGG TTCCAG CGCC GCAA GGCG TGAGAGTTCGAGTCTCTCCGTCCGC ACCA+5
Mlo105R GGTCCCGTAGCTCAG CTGGA TAGAGCACCGGCCTTCTA AGCCGA TGGTC ACAGGTTCGAATCCTGTCGGGATC GCCA+1
XQ1 V GGGCCCGTCGTCTAGCTTGGT TAGGACGTCGCCCTCACA CGGCGA AGATC CTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCC Atgt
Xac20H GGTGGCTGTAGCTCAG CTGGT TAGAGTACTGGATTGTGA TTCCAG ATGTC GGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCAC CCCA
Atu30G GCGGGTGTAGCTCAA TGGT AGAGCAGCAGCTTCCCA AGCTGA ATAC GAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGC TCCA
CP-933u S GGAGAGATGCCGGAG CGGCTGAACGGACCGGTCTCGAA AACCGGA GTGGGG GCAA CTCCACCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCC GCCA
XQ2 R GGACCCGTAGCTCAGCTAGGA TGGAGCGCCGGCCTTCGG AGCCGG TGGTC CCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC Gttg
SSV1 R GGACCCGTAGCTCAGCCAGGA TAGAGCACTGGCCTCCGG AGCCGG AGGTC CCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC Gtat
VWB R GCCTTCGTAGCTCAG GGGA TAGAGCACCGCTCTCCTA AAGCGG GTGTC GCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGC ACCA
phiU T GCTGCCGTAGCTCAG TGGT AGAGCACACCCTTGGTA AGGGTG AGGTC GGTGGTTCAATCCCACTCGGCAGC ACCA+6
Fels-2 X ...AAAGACTGACTAAGCATGTAGTACCGAGGATGTAGGA ATTTCG GAC GCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCC ACCA+2
SpaX ...AAAGACTGACTAAGCATGTAGTACCGAGGATGTAGGA ATTTCG GAC GCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCC ACCA+2
Lin39K GGGTTGTTAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCTGACTCTTA ATCAGC GGGTC GGGGGTTCGAAACCCTCACAACCC Atat+27
Pho4V GGGCCCGTGGTCTAG TTGGT CATGACGCCGCCCTTACG AGGCGG AGGTC CGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCC ACCA
Dra18R GCACCCTTAGCTCAG CTGGA TAGAGCAACCGCCTTCTA AGCGGT CGGTC GTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTGC ACCA
CP-933h T GCCGATATAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCGCATTCGTA ATGCGA AGGTC GTAGGTTCGACTCCTATTATCGGC ACCA+1
Efa25T GCCAGCTTAGCTCAG TTGGT AGAGCAACGCACTCGTA ACGCGT AGGTC GTAGGTTCGAACCCTATAGCTGGC Atag
186 I GGCCCTTTAGCTCAG TGGT TAGAGCAGGCGACTCATA ATCGCT TGGTC GCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCC ACCA+3
HP1 L GCCCGAGTGGTGGAA TCGGT AGACACAAGGGATTTAAA ATCCCT CGCCT TTCG AGGCG TGCCAGTTCAAGTCTGGCTTCGGGC ACCA+6
L5 G GCGGGCGTAGCTCAA TGGT AGAGCCCTAGTCTTCCA AACTAG CTAC GCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGC TCgg
P22 T GCCGATATAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCGCATTCGTA ATGCGA AGGTC GTAGGTTCGACTCCTATTATCGGC ACCA
pSE211 F GGCCAGGTAGCTCAG TTGGT ACGAGCGTCCGCCTGAAA AGCGGA AGGTC GGCGGTTCGACCCCGCCCCTGGCC ACCA+14
pSE101 T GCCGCTGTAGCTCAG TTGGT AGACCGCCCGCCTTGTA AGCGGA CGGTC AGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCGGC TCCg+1
Sco14R R GCCTCCGTAGCTCAG GGGA TAGAGCACCGCTCTCCTA AAGCGG GTGTC GCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGC ACaa
DLP12 R GCGCCCTTAGCTCAG TTGGA TAGAGCAACGACCTTCTA AGTCGT GGGCC GCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGC GCCA+2
Xcc37K GGGCCGTTAGCTCAG TCGGT AGAGCAGAAGACTTTTA ATCTTT TGGTC GATGGTTCGAATCCATCACGGCCC ACCA
pSAM2 P CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT AGCGCGCTTCGTTCGGG ACGAAG AGGTC GTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCG ACCg
pMEA300 I GGGCCTATAGCTCAG GCGGT TAGAGCGCTTCGCTGATA ACGAAG AGGTC GGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCC ACga
pKLC102 K GGGTCGTTAGCTCAG TCGGT AGAGCAGTTGGCTTTTA ACCAAT TGGTC GTAGGTTCGAATCCTACACGACCC ACCA+1
Sto7R GGACCCGTAGCTCAGCCAGGA TAGAGCGCCGGCCTTCGG AGCCGG TGGTC CCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC GCta
Sco154P CGGGACGTGGCGCAGCTTGGT AGCGCACTTGACTGGGG GTCAAG GGGTC GCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCG ACtc
Sto20M GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGT TAGAGCGCCGGACTCATAcggtaaggggacATCCGG TTGTC CGGGGTTCAAATCCCCGCGGCGGC ACtt
Xcc9X ...AACGGAGGGATAAGCATGTAGTGCTGGGGATGGAGTG CTTCCG GAC GGCGGTTCGATTCCGCCCACCTCC ACCA+1
Xac13S GGAGAGGTGTCCGAG TGGTTGAAGGAGCACGCCTGGAA AGTGTGTAAGCGT CTAAACCGCGCTTCGGGGGTTCGAATCCCCCTCTCTCC GCCA+2
MS6 A GGGGCTATGGCGCAG TTGGT AGCGCGACTCGTTCGCA TCGAGT AGGTC AGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCC ACCA
phiRv2 V GCGCGATTAGCTCAG CGGG AGAGCGCTTCCCTGACA CGGAAG AGGTC ACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGC ACCA
MX8 D GGGGAGTTAGTTCAG TTGGT TAGAACGCCGGCCTGTCA CGCCGG AGGCC ACGGGTTCAAGTCCCGTACTCCTC GCCA
Ecoc48X ...AAAGACTGACTAAGCATGTAGTACCGAGGATGTAGGA ATTTCG GAC GCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCC ACCA+9
phiCTX S GGAGGTGTGGCCGAG TGGTTTAAGGCAACGGTCTTGAA AACCGTC GAAGGG GAGA CTCTTCCGTGAGTTCGAATCTCACCGCCTCC GCCA+3
Pae12G GCGGGCGTCGTATAA TGGC ATTACCTGAGCTTCCCA AGCTCA TGAC GAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGC TCCA
Sme19T GCTGCTATAGCTCAG GGGT AGAGCACTCCCTTGGTA AGGGAG AGGCC GAGAGTTCAAATCTCTCTAGCAGC ACCA+8
Ecoo10L GCCGAAGTGGCGAAA TCGGT AGACGCAGTTGATTCAAA ATCAAC CGTA GAAA TACG TGCCGGTTCGAGTCCGGCCTTCGGC ACCA+1
Bha35X ...ACAGTGACTACGCTCGTAGAAGCTTAAGTACTCGTTA TTTCTG GAC GTGGGTTCGATTCCCACCGTCTCC Attt
Bme8T GCTGCGGTAGCTCAG TGGT AGAGCACTCCCTTGGTA AGGGAG AGGTC GAGAGTTCAATCCTCTCTCGCAGC ACCA+7
Ecoo9R GTCCTCTTAGTTAAA TGGA TATAACGAGCCCCTCCTA AGGGCT AATT GCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGAC ACCA
Ecoo5Z GGAAGATCGTCGTCTC CGGT GAGGCGGCTGGACTTCAA ATCCAGTTGGGGCCGCCAGCGGTCCCGGGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCCGCCA
SHE F GCCCGGATAGCTCAG TCGGT AGAGCAGGGGATTGAAA ATCCCC GTGTC CTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGC ACCA
Tvo32A GGGCCGGTAGATCAG CGGT AGATCGCCTGCTTCGCA AGCAGG AGGCC TCGGGTTCAAATCCCGACCGGTCC Attt
Stic11L GCCGAAGTGGCGAAA TCGGT AGACGCAGTTGATTCAAA ATCAAC CGTA GAAA TACG TGCCGGTTCGAGTCCGGCCTTCGGC ACCA+1
P4 L GCCGAAGTGGCGAAA TCGGT AGACGCAGTTGATTCAAA ATCAAC CGTA GAAA TACG TGCCGGTTCGAGTCCGGCCTTCGGC ACCA
phiR73 Z GGAAGATCGTCGTCTC CGGT GAGGCGGCTGGACTTCAA ATCCAGTTGGGGCCGCCAGCGGTCCCGGGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCCGCCA+4
T12 X ...AAGATCGACTAAGGACGTAGACAAATATGTTGGCAGG TGTTTG GAC GTGGGTTCGACTCCCACCAGCTCC Atca>30
Lla42X ...AGAAAGTCCTATGGTTGTAGACGTTGATGTAGCAAGG TGTTTG GAC AGGGGTTCGACTCCCCTCGCCTCC Attg>30
A2 L GCCGGTGTGGCGGAA TTGGC AGACGCGCGGGATTCAAA ATCCCG TTCCA GCGA TGGAG TATCGGTTCGACCCCGATCACCGGT Atca
Spnt3K GCCTCCTTAGCTCAG CTGGC AGAGCAGCGGACTCTTA ATCCGT GGGTC ACAGGTTCGATCCCTGTAGGGGGC Atat
Clc G GCGGGAATAGCTCAG TTGGT AGAGCACGACCTTGCCA AGGTCG GGGTC GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGC TCCA
Xac38G GCGGGCGTAGCTCAA TGGT AGAGCTGTAGCTTCCCA AGCTAC TGAC GTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGC TCCA
Xcc52S GGAGAGATGGCCGAG CGGTTTAAGGCACCGGTCTTGAA AACCGGC GAAGG GTCAAACCTTC CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCC GCCA
933i T GCCGATATAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCGCATTCGTA ATGCGA AGGTC GTAGGTTCGACTCCTATTATCGGC ACCA+?
SymbIsl F GCCCAGATAGCTCAG TTGGT AGAGCAGCGGACTGAAA ATCCGC GTGTC GGTGGTTCGAATCCGCCTCTGGGC ACCA+2
Xac21X TCTAACGGAGGGCTAAGCATGTAGTGCTGGGGATGGAGTG CTTCCG GAC GGCGGTTCGATTCCGCCCACCTCC ACCA
SaGIm X ...TCGATAAACTACACACGTAGAAAGATGTGTATCAGGA CCTCTG GAC GCGGGTTCAAATCCCGCCGTCTCC Atat
Rso42L GCGAGGGTGGCGAAA TTGGT AGACGCACCAGGTTTAG GTCCTG ACGCCA GCAA TGGTGT AGGGGTTCGAGTCCCCTCCCTCGC ACCA+1
Stic6G GCGGGCGTAGTTCAA TGGT AGAACGAGAGCTTCCCA AGCTCT ATAC GAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGC TCCA
bIL309 R GGTCCGATAGCTCAG CTGGA TAGAGCATTCGCCTTCTA AGCGAA CGGTC GAGGGTTCGAATCCCCCTCGGATC Atgg+12
phi10MC L GCCCCAATGGCGGAA TTGGC AGACGCGCAGCGTTCAGG TCGCTG TGAGA GCAA TCTCG TGCAGGTTCGACTCCTGTTTGGGGC Atta
MV4 S GGAGAGTTGGCAGAG CGGT AATGCAGCGGACTCGAA ATCCGCCGAGCCAATGTTGAATTGGTGCGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCC Ttaa
HPI N TCCTCTGTAGTTCAG TCGGT AGAACGGCGGACTGTTA ATCCGT ATGTC ACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGA GCCA+1
Xcc31G GCGGGAATAGCTCAG TTGGT AGAGCGCAACCTTGCCA AGGTTG AGGTC GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGC TCCA+3
Rso16R CTCGCCGTAGCACAA TGGA TAGTGCACGCGCCTCCTA AGCGTG AGAT ACAGGTTCGATTCCTGTCGGCGGG ACCA+2
Ype36N TCCTCTGTAGTTCAG TCGGT AGAACGGCGGACTGTTA ATCCGT ATGTC ACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGA GCCA+1
NBU1 L GCCCAGATGGCGGAA TCGGT AGACGCGCTGGTCTCAAA CACCAG TGGATTCACT TCCA TCCCGGTTCGACCCCGGGTGTGGGT ACCA
NBU2 S GGAGAGGTGGCAGAG TGGTCGATTGCGGCGGTCTTGAA AACCGTT GTACT GCGA GGTAC CCGGGGTTCGAATCCCTGTCTCTCC GCtg
Ype11X ...ATGATTGGACTAAGCATGTAGTGCCGACGGTGTAGTA ATTTCG GAC GGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCC ACCA>30
Rso41S GGAGAGATGGATGAG TGGT TTAAGTCGCACGCCTGG AAAGCGTGTATAGGTTAATAGCCTATC GGGGGTTCGAATCCCCCTCTCTCC GCCA+3
Tac12V GGGCTCGTAGTCTAG TGGT ATGATGTCGCCCTGACA CGGCGG AGGTC ACCGGTTCGAATCCGGTCGGGCCC ACtt
CPS-53 R GTCCTCTTAGTTAAA TGGA TATAACGAGCCCCTCCTA AGGGCT AATT GCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGAC ACCA+1
TPW22 C GGCGGCGTAGTGAAG TGGT AACACATGGCTCTGCAA AAGCTT AATC GTCGGTTCAAATCCGACCGTCGCC Ttaa
Sfi21 R GTCCTCTTAGTTAAA TGGA TATAACAACTCCCTCCTA AGGAGT CGTT GCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGAC Attt+18
phiFlu L GCCTGGGTGGCGAAA TTGGT AGACGCAGCGGATTCAAA ATCCGC CGTT GAATA AACG TGTCGGTTCGAGTCCGACCCTAGGC ACCA
Vap S GGAGAGGTGGCCAGA GTGGCTGAAGGCACTCCCCTGCTA AGGGAGC ATAGGGTTTATAGCTCTATCGAGAGTTCGAATCTCTTCCTCTCC GCCA
CP4-57 X ...AAAGACTGACTAAGCATGTAGTACCGAGGATGTAGGA ATTTCG GAC GCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCC ACCA+1
Oi43 S GGTGAGGTGTCCGAG TGGCTGAAGGAGCACGCCTGGAA AGTGTGT ATACG GCAA CGTAT CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACC GCCA
Sme21T GCCGCTTTAGCTCAG TCGGT AGAGCACATCATTCGTA ATGATG GGGTC ACGTGTTCGAGTCACGTAAGCGGC ACCA+2
VPIphi X ...AGACATAACCTATGCATGTAGTACCAAAGATGAATGG TTTTCG GAC GGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCC ACCA
Oi108 X ...AAAGACTGACTAAGCATGTAGTACCGAGGACGTAGGA ATTTCG GAC GCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCC ACCA
tRNA 2¡: ******* ++++---Dloop---++++ |||||- Aloop (intron) -||||| vvvvv-Vloop-vvvvv ooooo-Tloop-ooooo******* &
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